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PROTEO 3.2.1 – La Chromatographie Liquide appliquée à la Détection par Spectrométrie de Masse

Deux journées reprenant toutes les notions essentielles pour débuter dans les techniques de chromatographie liquide appliquée à la spectrométrie de masse…
Prochaine édition : à venir
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Présentation

Cette formation propose une approche pratique de l’utilisation de la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse pour analyser des échantillons protéiques. Les participants apprendront à préparer et pré-traiter des échantillons, à séparer les peptides par UPLC, et à automatiser les analyses en ligne avec des systèmes de spectrométrie de masse en tandem (Q-ToF et Ion Trap). L’acquisition des données en modes dépendants et indépendants (MS/MS, SWATH) sera démontrée, et les spectres de fragmentation obtenus seront analysés afin d’identifier et de quantifier des protéines. Les résultats seront discutés de manière critique pour valider les méthodes utilisées.

Programme

  • Préparation / pré-traitement des échantillons protéiques (digestion par protéase, …)
  • Introduction à l’acquisition des données en mode dépendant et indépendant (MS/MS, SWATH) > démonstration
  • Analyse des échantillons (mélange protéique) par spectrométrie de masse en tandem
    • Séparation des peptides par UPLC
    • Couplage de l’UPLC avec le spectromètre de masse et automatisation des analyses
    • Analyse en ligne des peptides élués par spectrométrie de masse en tandem (Q-ToF et Ion Trap)
  • Analyse des spectres de fragmentation obtenus
  • Analyses bio-informatiques afin d’identifier une protéine à partir des spectres de fragmentation obtenus > discussion critique des résultats obtenus
  • Quantification de protéines à partir d’un mélange complexe > discussion critique des résultats obtenus
  • Mise en place de méthodes de validation ciblées 

Méthodologie

Analyses de données/discussions
Pratique
Démonstrations / visite labos

Objectif

Retracer le cheminement complet d’une expérience de spectrométrie de masse en tandem, de la préparation d’échantillons à l’identification de protéines

Equipe pédagogique

Intervenants

Spécialistes du Service de Protéomie et Microbiologie de l’UMons :

  • Prof. Baptiste LEROY,
    PhD et chef de travaux
  • Tania KARASIEWICZ,
    PostDoc

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Horaire

2 jours de formation

Prochaine session : 

  • à venir

Lieu

Sur le campus la Plaine (Ixelles)
(Plan d’accès au campus)

Admission

Pour qui ?

  • Travailleurs du secteur biotechnologique : responsables de projet, techniciens de laboratoire, biotechnologues, chercheurs…
  • Enseignants des Hautes Ecoles

Prérequis

Tarifs

Tarif plein :

  • 760€

Tarif réduit pour les institutions publiques, académiques et ASBL :

  • 530 €

Tarif réduit pour les doctorants & institutions hospitalières ULB :

  •  380€

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Contact

Valérie LAMBERT

Coordinatrice de formation

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F.A.Q

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